Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUDPQ08623 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PUDPQ08623 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms