Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGM3Q08188 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms