Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP4Q07065 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKAP4Q07065 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms