Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CD164Q04900 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CD164Q04900 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD164Q04900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD164Q04900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD164Q04900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD164Q04900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD164Q04900 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD164Q04900 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD164Q04900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CD164Q04900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD164Q04900 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD164Q04900 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD164Q04900 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD164Q04900 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD164Q04900 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD164Q04900 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD164Q04900 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD164Q04900 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CD164Q04900 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms