Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP7AQ04656 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP7AQ04656 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ATP7AQ04656 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ATP7AQ04656 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms