Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBE1Q04446 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBE1Q04446 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms