Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGFBR3Q03167 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms