Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC3AQ02505 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC3AQ02505 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC3AQ02505 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms