Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP27A1Q02318 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CYP27A1Q02318 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYP27A1Q02318 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP27A1Q02318 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms