Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPEQ02224 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPEQ02224 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPEQ02224 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPEQ02224 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPEQ02224 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPEQ02224 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPEQ02224 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPEQ02224 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPEQ02224 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPEQ02224 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPEQ02224 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPEQ02224 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPEQ02224 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPEQ02224 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPEQ02224 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPEQ02224 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPEQ02224 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPEQ02224 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPEQ02224 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPEQ02224 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPEQ02224 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPEQ02224 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CENPEQ02224 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms