Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DHODHQ02127 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DHODHQ02127 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms