Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A3Q01959 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A3Q01959 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC6A3Q01959 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A3Q01959 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms