Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA6Q01524 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms