Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTBN1Q01082 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms