Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1BQ00975 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1BQ00975 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms