Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP1Q00587 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP1Q00587 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms