Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK17Q00537 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK17Q00537 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK17Q00537 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK17Q00537 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms