Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDLBPQ00341 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDLBPQ00341 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDLBPQ00341 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms