Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VLDLRP98155 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VLDLRP98155 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VLDLRP98155 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms