Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTRA4P83105 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTRA4P83105 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTRA4P83105 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTRA4P83105 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA4P83105 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms