Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX3P78415 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX3P78415 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX3P78415 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX3P78415 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX3P78415 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX3P78415 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX3P78415 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX3P78415 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX3P78415 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX3P78415 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX3P78415 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX3P78415 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX3P78415 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX3P78415 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX3P78415 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX3P78415 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX3P78415 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX3P78415 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX3P78415 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX3P78415 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX3P78415 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX3P78415 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX3P78415 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX3P78415 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX3P78415 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX3P78415 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX3P78415 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX3P78415 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX3P78415 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX3P78415 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX3P78415 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX3P78415 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX3P78415 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX3P78415 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX3P78415 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX3P78415 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX3P78415 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX3P78415 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX3P78415 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX3P78415 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX3P78415 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX3P78415 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX3P78415 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX3P78415 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX3P78415 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX3P78415 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX3P78415 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX3P78415 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX3P78415 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX3P78415 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX3P78415 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX3P78415 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX3P78415 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX3P78415 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX3P78415 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX3P78415 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX3P78415 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX3P78415 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX3P78415 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX3P78415 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX3P78415 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms