Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HBBP68871 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HBBP68871 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HBBP68871 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HBBP68871 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HBBP68871 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HBBP68871 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HBBP68871 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HBBP68871 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HBBP68871 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HBBP68871 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HBBP68871 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HBBP68871 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HBBP68871 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HBBP68871 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HBBP68871 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HBBP68871 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HBBP68871 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HBBP68871 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms