Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB4BP68371 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB4BP68371 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4BP68371 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms