Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNC1P63316 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNC1P63316 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC1P63316 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC1P63316 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC1P63316 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms