Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-24P63145 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-24P63145 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-24P63145 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms