Protein–RNA interactions for Protein: P63010

AP2B1, AP-2 complex subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2B1P63010 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP2B1P63010 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP2B1P63010 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2B1P63010 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP2B1P63010 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms