Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1AP62820 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB1AP62820 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB1AP62820 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB1AP62820 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB1AP62820 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1AP62820 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1AP62820 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1AP62820 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB1AP62820 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1AP62820 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1AP62820 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1AP62820 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1AP62820 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1AP62820 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1AP62820 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1AP62820 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1AP62820 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1AP62820 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1AP62820 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1AP62820 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms