Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNAP25P60880 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP25P60880 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP25P60880 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms