Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERVFRD-1P60508 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms