Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP4BP1P59074 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP4BP1P59074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BP1P59074 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms