Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD18P57730 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD18P57730 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD18P57730 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD18P57730 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD18P57730 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD18P57730 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD18P57730 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD18P57730 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD18P57730 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARD18P57730 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CARD18P57730 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARD18P57730 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARD18P57730 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD18P57730 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD18P57730 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD18P57730 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD18P57730 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD18P57730 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD18P57730 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD18P57730 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD18P57730 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD18P57730 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD18P57730 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD18P57730 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD18P57730 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD18P57730 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD18P57730 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD18P57730 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD18P57730 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD18P57730 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD18P57730 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD18P57730 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD18P57730 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD18P57730 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD18P57730 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD18P57730 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARD18P57730 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARD18P57730 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARD18P57730 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARD18P57730 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARD18P57730 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD18P57730 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD18P57730 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD18P57730 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms