Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF3P57682 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF3P57682 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLF3P57682 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF3P57682 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF3P57682 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF3P57682 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF3P57682 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF3P57682 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF3P57682 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF3P57682 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF3P57682 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF3P57682 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF3P57682 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF3P57682 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF3P57682 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF3P57682 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF3P57682 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF3P57682 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF3P57682 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF3P57682 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF3P57682 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF3P57682 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF3P57682 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF3P57682 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF3P57682 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF3P57682 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF3P57682 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF3P57682 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF3P57682 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF3P57682 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF3P57682 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF3P57682 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF3P57682 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF3P57682 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms