Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX4P57082 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX4P57082 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX4P57082 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX4P57082 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX4P57082 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX4P57082 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX4P57082 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX4P57082 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX4P57082 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX4P57082 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX4P57082 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX4P57082 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX4P57082 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX4P57082 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX4P57082 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX4P57082 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX4P57082 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX4P57082 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX4P57082 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX4P57082 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX4P57082 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX4P57082 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX4P57082 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX4P57082 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX4P57082 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX4P57082 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX4P57082 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX4P57082 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX4P57082 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX4P57082 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX4P57082 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX4P57082 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX4P57082 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX4P57082 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX4P57082 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX4P57082 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX4P57082 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX4P57082 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX4P57082 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX4P57082 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX4P57082 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX4P57082 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX4P57082 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX4P57082 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX4P57082 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX4P57082 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX4P57082 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX4P57082 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX4P57082 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX4P57082 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX4P57082 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX4P57082 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX4P57082 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBX4P57082 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBX4P57082 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBX4P57082 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX4P57082 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms