Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBASH3AP57075 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBASH3AP57075 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBASH3AP57075 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms