Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX3P56589 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX3P56589 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX3P56589 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX3P56589 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX3P56589 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX3P56589 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX3P56589 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX3P56589 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX3P56589 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX3P56589 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX3P56589 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX3P56589 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX3P56589 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX3P56589 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX3P56589 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX3P56589 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX3P56589 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX3P56589 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX3P56589 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX3P56589 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX3P56589 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX3P56589 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX3P56589 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX3P56589 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX3P56589 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PEX3P56589 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PEX3P56589 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PEX3P56589 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PEX3P56589 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX3P56589 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX3P56589 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX3P56589 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX3P56589 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX3P56589 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX3P56589 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX3P56589 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX3P56589 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX3P56589 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX3P56589 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX3P56589 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX3P56589 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX3P56589 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX3P56589 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX3P56589 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX3P56589 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX3P56589 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX3P56589 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX3P56589 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX3P56589 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX3P56589 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX3P56589 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX3P56589 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX3P56589 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX3P56589 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX3P56589 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX3P56589 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX3P56589 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX3P56589 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX3P56589 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX3P56589 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX3P56589 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX3P56589 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX3P56589 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX3P56589 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX3P56589 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX3P56589 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX3P56589 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX3P56589 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX3P56589 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX3P56589 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX3P56589 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX3P56589 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX3P56589 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms