Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPHB4P54760 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB4P54760 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHB4P54760 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms