Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP12AP54707 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP12AP54707 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms