Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC5A3P53794 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms