Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 CDC11YJR076C 1248 nt7.04□□□□□ -1.28
RTA1P53047 YLR162WYLR162W 357 nt7.04□□□□□ -1.28
RTA1P53047 YOX1YML027W 1158 nt7.04□□□□□ -1.28
RTA1P53047 RDL1YOR285W 420 nt7.04□□□□□ -1.28
RTA1P53047 YCL049CYCL049C 939 nt7.04□□□□□ -1.28
RTA1P53047 SMC5YOL034W 3282 nt7.04□□□□□ -1.28
RTA1P53047 TUF1YOR187W 1314 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 ERS1YCR075C 783 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 snR78snR78 87 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 MRPL25YGR076C 474 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 SPC24YMR117C 642 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 DFR1YOR236W 636 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 RKM4YDR257C 1485 nt7.03□□□□□ -1.28
RTA1P53047 PPT1YGR123C 1542 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 ECM10YEL030W 1935 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 GUF1YLR289W 1938 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 SUA5YGL169W 1281 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 AIM46YHR199C 933 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YKR075CYKR075C 924 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 URE2YNL229C 1065 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 HER2YMR293C 1395 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 CYB2YML054C 1776 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YIL108WYIL108W 2091 nt7.02□□□□□ -1.29
RTA1P53047 SRF1YDL133W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YMR027WYMR027W 1413 nt7.01□□□□□ -1.29
RTA1P53047 APE4YHR113W 1473 nt7.01□□□□□ -1.29
RTA1P53047 PTC7YHR076W 1032 nt7.01□□□□□ -1.29
RTA1P53047 GFD1YMR255W 567 nt7.01□□□□□ -1.29
RTA1P53047 SPO77YLR341W 1434 nt7.01□□□□□ -1.29
RTA1P53047 NDE1YMR145C 1683 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 TAH11YJR046W 1815 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 RDN5-2RDN5-2 119 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 RDN5-3RDN5-3 119 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 RDN5-4RDN5-4 119 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 RDN5-5RDN5-5 119 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 PPA2YMR267W 933 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 MRPL36YBR122C 534 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 VBA5YKR105C 1749 nt7□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YDR132CYDR132C 1488 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YBR241CYBR241C 1467 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 FZF1YGL254W 900 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 REC107YJR021C 945 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YJU2YKL095W 837 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 HEM15YOR176W 1182 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 HBN1YCL026C-B 582 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 SAS4YDR181C 1446 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YPL247CYPL247C 1572 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 CTF18YMR078C 2226 nt6.99□□□□□ -1.29
RTA1P53047 SAL1YNL083W 1485 nt6.98□□□□□ -1.29
RTA1P53047 MED4YOR174W 855 nt6.98□□□□□ -1.29
RTA1P53047 PAC2YER007W 1557 nt6.98□□□□□ -1.29
RTA1P53047 NTG1YAL015C 1200 nt6.97□□□□□ -1.29
RTA1P53047 MSA2YKR077W 1092 nt6.97□□□□□ -1.29
RTA1P53047 SPG5YMR191W 1122 nt6.97□□□□□ -1.29
RTA1P53047 MMR1YLR190W 1476 nt6.97□□□□□ -1.29
RTA1P53047 YMR034CYMR034C 1305 nt6.97□□□□□ -1.29
RTA1P53047 KIN1YDR122W 3195 nt6.96□□□□□ -1.29
RTA1P53047 RAM1YDL090C 1296 nt6.96□□□□□ -1.3
RTA1P53047 PCL6YER059W 1263 nt6.96□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YGL102CYGL102C 429 nt6.96□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YIP4YGL198W 708 nt6.96□□□□□ -1.3
RTA1P53047 FES1YBR101C 873 nt6.96□□□□□ -1.3
RTA1P53047 LPL1YOR059C 1353 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 FCP1YMR277W 2199 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 GPA1YHR005C 1419 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 AAD6YFL056C 639 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 RPL2BYIL018W 765 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 REX3YLR107W 1215 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 RPL31BYLR406C 342 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 SML1YML058W 315 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 NDJ1YOL104C 1059 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 ERG10YPL028W 1197 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 HXT13YEL069C 1695 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 MFG1YDL233W 1377 nt6.95□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YJL163CYJL163C 1668 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 MED2YDL005C 1296 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YDL023CYDL023C 321 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 LSM12YHR121W 564 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YLL056CYLL056C 897 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 MRPL19YNL185C 477 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 SMX3YPR182W 261 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 WTM1YOR230W 1314 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 ATG7YHR171W 1893 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 CCT3YJL014W 1605 nt6.94□□□□□ -1.3
RTA1P53047 snR57snR57 88 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YDL177CYDL177C 513 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 MRPS28YDR337W 861 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 TRS31YDR472W 852 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 FIT2YOR382W 462 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 PET20YPL159C 762 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YPR076WYPR076W 375 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 PPS1YBR276C 2424 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 SEC23YPR181C 2307 nt6.93□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YFR006WYFR006W 1608 nt6.92□□□□□ -1.3
RTA1P53047 PEX7YDR142C 1128 nt6.92□□□□□ -1.3
RTA1P53047 ADK2YER170W 678 nt6.92□□□□□ -1.3
RTA1P53047 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.92□□□□□ -1.3
RTA1P53047 CBR1YIL043C 855 nt6.92□□□□□ -1.3
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