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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
CDC11
YJR076C
1248 nt
7.04
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
YLR162W
YLR162W
357 nt
7.04
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
YOX1
YML027W
1158 nt
7.04
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
RDL1
YOR285W
420 nt
7.04
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
YCL049C
YCL049C
939 nt
7.04
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
SMC5
YOL034W
3282 nt
7.04
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
TUF1
YOR187W
1314 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
ERS1
YCR075C
783 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
snR78
snR78
87 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
MRPL25
YGR076C
474 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
SPC24
YMR117C
642 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
YMR306C-A
YMR306C-A
390 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
DFR1
YOR236W
636 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
RKM4
YDR257C
1485 nt
7.03
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
PPT1
YGR123C
1542 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
ECM10
YEL030W
1935 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
GUF1
YLR289W
1938 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
SUA5
YGL169W
1281 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
AIM46
YHR199C
933 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YKR075C
YKR075C
924 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
URE2
YNL229C
1065 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
HER2
YMR293C
1395 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
CYB2
YML054C
1776 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YIL108W
YIL108W
2091 nt
7.02
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
SRF1
YDL133W
1314 nt
7.01
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YMR027W
YMR027W
1413 nt
7.01
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
APE4
YHR113W
1473 nt
7.01
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
PTC7
YHR076W
1032 nt
7.01
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
GFD1
YMR255W
567 nt
7.01
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
SPO77
YLR341W
1434 nt
7.01
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
NDE1
YMR145C
1683 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
TAH11
YJR046W
1815 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
RDN5-2
RDN5-2
119 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
RDN5-3
RDN5-3
119 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
RDN5-4
RDN5-4
119 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
RDN5-5
RDN5-5
119 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
PPA2
YMR267W
933 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
MRPL36
YBR122C
534 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
VBA5
YKR105C
1749 nt
7
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YDR132C
YDR132C
1488 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YBR241C
YBR241C
1467 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
FZF1
YGL254W
900 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
REC107
YJR021C
945 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YJU2
YKL095W
837 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
HEM15
YOR176W
1182 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
HBN1
YCL026C-B
582 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
SAS4
YDR181C
1446 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YPL247C
YPL247C
1572 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
CTF18
YMR078C
2226 nt
6.99
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
SAL1
YNL083W
1485 nt
6.98
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
MED4
YOR174W
855 nt
6.98
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
PAC2
YER007W
1557 nt
6.98
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
NTG1
YAL015C
1200 nt
6.97
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
MSA2
YKR077W
1092 nt
6.97
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
SPG5
YMR191W
1122 nt
6.97
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
MMR1
YLR190W
1476 nt
6.97
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
YMR034C
YMR034C
1305 nt
6.97
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
KIN1
YDR122W
3195 nt
6.96
□□□□□ -1.29
RTA1
P53047
RAM1
YDL090C
1296 nt
6.96
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
PCL6
YER059W
1263 nt
6.96
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YGL102C
YGL102C
429 nt
6.96
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YIP4
YGL198W
708 nt
6.96
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
FES1
YBR101C
873 nt
6.96
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
LPL1
YOR059C
1353 nt
6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
FCP1
YMR277W
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6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
GPA1
YHR005C
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6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
AAD6
YFL056C
639 nt
6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
RPL2B
YIL018W
765 nt
6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YIR020W-A
YIR020W-A
243 nt
6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
REX3
YLR107W
1215 nt
6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
RPL31B
YLR406C
342 nt
6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
SML1
YML058W
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6.95
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
NDJ1
YOL104C
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
ERG10
YPL028W
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
HXT13
YEL069C
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RTA1
P53047
MFG1
YDL233W
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RTA1
P53047
YJL163C
YJL163C
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6.94
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
MED2
YDL005C
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
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YDL023C
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RTA1
P53047
LSM12
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6.94
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YLL056C
YLL056C
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6.94
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
MRPL19
YNL185C
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RTA1
P53047
SMX3
YPR182W
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
WTM1
YOR230W
1314 nt
6.94
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
ATG7
YHR171W
1893 nt
6.94
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
CCT3
YJL014W
1605 nt
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
snR57
snR57
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YDL177C
YDL177C
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RTA1
P53047
MRPS28
YDR337W
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RTA1
P53047
TRS31
YDR472W
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RTA1
P53047
FIT2
YOR382W
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RTA1
P53047
PET20
YPL159C
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6.93
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YPR076W
YPR076W
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
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YBR276C
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P53047
SEC23
YPR181C
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
YFR006W
YFR006W
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6.92
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
PEX7
YDR142C
1128 nt
6.92
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
ADK2
YER170W
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□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
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YFL013W-A
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6.92
□□□□□ -1.3
RTA1
P53047
CBR1
YIL043C
855 nt
6.92
□□□□□ -1.3
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