Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8P50990 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8P50990 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8P50990 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8P50990 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8P50990 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8P50990 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8P50990 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8P50990 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8P50990 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8P50990 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8P50990 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8P50990 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8P50990 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8P50990 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8P50990 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8P50990 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8P50990 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8P50990 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8P50990 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8P50990 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8P50990 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8P50990 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8P50990 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8P50990 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8P50990 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8P50990 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8P50990 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8P50990 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8P50990 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8P50990 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8P50990 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8P50990 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8P50990 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8P50990 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8P50990 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8P50990 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT8P50990 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8P50990 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8P50990 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8P50990 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT8P50990 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT8P50990 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT8P50990 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8P50990 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8P50990 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8P50990 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8P50990 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8P50990 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT8P50990 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8P50990 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8P50990 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8P50990 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8P50990 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8P50990 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8P50990 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8P50990 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms