Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF10P50591 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFSF10P50591 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF10P50591 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms