Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPFP49454 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPFP49454 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPFP49454 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPFP49454 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPFP49454 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPFP49454 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPFP49454 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPFP49454 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPFP49454 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPFP49454 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPFP49454 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPFP49454 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CENPFP49454 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPFP49454 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPFP49454 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPFP49454 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPFP49454 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPFP49454 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPFP49454 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPFP49454 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPFP49454 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPFP49454 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPFP49454 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPFP49454 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPFP49454 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPFP49454 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPFP49454 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPFP49454 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPFP49454 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPFP49454 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPFP49454 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPFP49454 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPFP49454 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPFP49454 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPFP49454 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPFP49454 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPFP49454 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPFP49454 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPFP49454 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPFP49454 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPFP49454 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPFP49454 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPFP49454 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPFP49454 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPFP49454 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPFP49454 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPFP49454 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPFP49454 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPFP49454 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPFP49454 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPFP49454 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPFP49454 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPFP49454 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPFP49454 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPFP49454 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPFP49454 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPFP49454 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPFP49454 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPFP49454 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPFP49454 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPFP49454 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPFP49454 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPFP49454 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPFP49454 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPFP49454 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms