Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRPC1P48995 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPC1P48995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC1P48995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms