Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX1P48742 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX1P48742 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX1P48742 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX1P48742 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX1P48742 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX1P48742 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX1P48742 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX1P48742 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX1P48742 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX1P48742 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX1P48742 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX1P48742 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LHX1P48742 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX1P48742 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX1P48742 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX1P48742 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX1P48742 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX1P48742 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX1P48742 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX1P48742 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX1P48742 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX1P48742 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX1P48742 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX1P48742 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX1P48742 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX1P48742 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX1P48742 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX1P48742 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX1P48742 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX1P48742 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX1P48742 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX1P48742 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX1P48742 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX1P48742 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX1P48742 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX1P48742 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX1P48742 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX1P48742 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX1P48742 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX1P48742 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX1P48742 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX1P48742 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX1P48742 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX1P48742 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX1P48742 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX1P48742 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX1P48742 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LHX1P48742 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms