Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP5P45974 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP5P45974 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP5P45974 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP5P45974 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP5P45974 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP5P45974 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP5P45974 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP5P45974 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP5P45974 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP5P45974 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP5P45974 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP5P45974 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP5P45974 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP5P45974 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP5P45974 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP5P45974 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP5P45974 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP5P45974 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP5P45974 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP5P45974 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP5P45974 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP5P45974 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP5P45974 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP5P45974 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP5P45974 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP5P45974 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP5P45974 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP5P45974 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP5P45974 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP5P45974 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP5P45974 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP5P45974 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP5P45974 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP5P45974 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP5P45974 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP5P45974 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP5P45974 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP5P45974 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP5P45974 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP5P45974 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP5P45974 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP5P45974 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP5P45974 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP5P45974 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP5P45974 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP5P45974 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP5P45974 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP5P45974 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP5P45974 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP5P45974 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP5P45974 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP5P45974 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP5P45974 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP5P45974 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP5P45974 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP5P45974 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP5P45974 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP5P45974 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP5P45974 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP5P45974 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP5P45974 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP5P45974 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP5P45974 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP5P45974 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP5P45974 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP5P45974 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP5P45974 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP5P45974 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP5P45974 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP5P45974 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP5P45974 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP5P45974 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP5P45974 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP5P45974 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP5P45974 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP5P45974 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP5P45974 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP5P45974 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP5P45974 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP5P45974 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP5P45974 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP5P45974 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP5P45974 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP5P45974 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP5P45974 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP5P45974 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP5P45974 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP5P45974 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP5P45974 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP5P45974 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP5P45974 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP5P45974 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP5P45974 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms