Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A2P43354 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A2P43354 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A2P43354 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms