Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPGP40121 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPGP40121 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPGP40121 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPGP40121 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPGP40121 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPGP40121 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPGP40121 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPGP40121 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPGP40121 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPGP40121 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPGP40121 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPGP40121 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPGP40121 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPGP40121 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPGP40121 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPGP40121 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPGP40121 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPGP40121 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPGP40121 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPGP40121 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPGP40121 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPGP40121 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPGP40121 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPGP40121 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPGP40121 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPGP40121 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPGP40121 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPGP40121 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPGP40121 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPGP40121 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPGP40121 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPGP40121 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPGP40121 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPGP40121 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPGP40121 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPGP40121 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPGP40121 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPGP40121 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPGP40121 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPGP40121 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPGP40121 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPGP40121 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPGP40121 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPGP40121 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPGP40121 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPGP40121 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPGP40121 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPGP40121 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPGP40121 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPGP40121 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPGP40121 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPGP40121 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPGP40121 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms