Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP12P39900 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP12P39900 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP12P39900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP12P39900 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP12P39900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP12P39900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP12P39900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP12P39900 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP12P39900 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP12P39900 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP12P39900 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP12P39900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP12P39900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP12P39900 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP12P39900 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP12P39900 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP12P39900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP12P39900 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP12P39900 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP12P39900 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP12P39900 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP12P39900 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP12P39900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP12P39900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP12P39900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP12P39900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP12P39900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP12P39900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP12P39900 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP12P39900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP12P39900 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP12P39900 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP12P39900 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP12P39900 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP12P39900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP12P39900 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP12P39900 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP12P39900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP12P39900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP12P39900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP12P39900 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP12P39900 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP12P39900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms