Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2IP36954 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2IP36954 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2IP36954 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms