Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCK1P35558 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCK1P35558 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCK1P35558 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCK1P35558 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCK1P35558 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCK1P35558 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCK1P35558 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCK1P35558 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCK1P35558 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCK1P35558 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCK1P35558 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCK1P35558 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCK1P35558 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK1P35558 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCK1P35558 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCK1P35558 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCK1P35558 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCK1P35558 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCK1P35558 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCK1P35558 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK1P35558 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK1P35558 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK1P35558 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK1P35558 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK1P35558 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK1P35558 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCK1P35558 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCK1P35558 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCK1P35558 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCK1P35558 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCK1P35558 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCK1P35558 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK1P35558 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK1P35558 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK1P35558 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK1P35558 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK1P35558 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK1P35558 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCK1P35558 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCK1P35558 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCK1P35558 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCK1P35558 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCK1P35558 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCK1P35558 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCK1P35558 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCK1P35558 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCK1P35558 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCK1P35558 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCK1P35558 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCK1P35558 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCK1P35558 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCK1P35558 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCK1P35558 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCK1P35558 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCK1P35558 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCK1P35558 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCK1P35558 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCK1P35558 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCK1P35558 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCK1P35558 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCK1P35558 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCK1P35558 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCK1P35558 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCK1P35558 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCK1P35558 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCK1P35558 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCK1P35558 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCK1P35558 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCK1P35558 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCK1P35558 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms